Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc127Q3TC33 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms