Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccbe1Q3MI99 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccbe1Q3MI99 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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