Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam171bQ14CH0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Fam171bQ14CH0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam171bQ14CH0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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