Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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VgfQ0VGU4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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VgfQ0VGU4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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VgfQ0VGU4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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VgfQ0VGU4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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VgfQ0VGU4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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VgfQ0VGU4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VgfQ0VGU4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VgfQ0VGU4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VgfQ0VGU4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VgfQ0VGU4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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VgfQ0VGU4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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VgfQ0VGU4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VgfQ0VGU4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VgfQ0VGU4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VgfQ0VGU4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VgfQ0VGU4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VgfQ0VGU4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms