Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2b3Q0VF55 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms