Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rundc1Q0VDN7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rundc1Q0VDN7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms