Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab42Q0PD08 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms