Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Neurl1bQ0MW30 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms