Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttc21bQ0HA38 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttc21bQ0HA38 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms