Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdr16c6Q05A13 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms