Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn6Q03958 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn6Q03958 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms