Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tff2Q03404 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tff2Q03404 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms