Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EgfrQ01279 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms