Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AlkP97793 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AlkP97793 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AlkP97793 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AlkP97793 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlkP97793 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlkP97793 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlkP97793 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AlkP97793 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlkP97793 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlkP97793 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlkP97793 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlkP97793 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlkP97793 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlkP97793 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AlkP97793 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlkP97793 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlkP97793 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlkP97793 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlkP97793 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlkP97793 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlkP97793 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AlkP97793 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AlkP97793 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AlkP97793 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlkP97793 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlkP97793 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlkP97793 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlkP97793 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AlkP97793 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlkP97793 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlkP97793 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlkP97793 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlkP97793 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlkP97793 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlkP97793 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlkP97793 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlkP97793 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlkP97793 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlkP97793 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlkP97793 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlkP97793 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlkP97793 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlkP97793 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AlkP97793 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AlkP97793 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AlkP97793 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AlkP97793 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms