Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cited1P97769 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms