Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms