Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tp53bp1P70399 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms