Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps3P62908 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps3P62908 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3P62908 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3P62908 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3P62908 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3P62908 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3P62908 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3P62908 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3P62908 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3P62908 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3P62908 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3P62908 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3P62908 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3P62908 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rps3P62908 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rps3P62908 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps3P62908 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3P62908 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rps3P62908 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms