Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab3cP62823 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab3cP62823 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab3cP62823 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab3cP62823 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab3cP62823 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab3cP62823 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab3cP62823 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab3cP62823 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab3cP62823 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab3cP62823 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab3cP62823 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms