Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp46P62069 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp46P62069 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp46P62069 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp46P62069 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp46P62069 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp46P62069 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp46P62069 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp46P62069 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp46P62069 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp46P62069 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp46P62069 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Usp46P62069 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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