Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chp1P61022 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chp1P61022 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms