Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CirbpP60824 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CirbpP60824 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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