Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp3P58854 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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