Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms