Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dpf3P58269 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dpf3P58269 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms