Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrpa1P57784 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms