Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms