Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux1P53564 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux1P53564 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux1P53564 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux1P53564 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux1P53564 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cux1P53564 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms