Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Map3k1P53349 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms