Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2e3P52483 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2e3P52483 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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