Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa6P50704 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa6P50704 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa6P50704 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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