Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LtbrP50284 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms