Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxc13P50207 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms