Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf1P46099 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms