Protein–RNA interactions for Protein: P43029

Gdf7, Growth/differentiation factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf7P43029 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf7P43029 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms