Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf5P43027 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms