Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TfamP40630 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TfamP40630 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TfamP40630 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TfamP40630 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms