Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik2P39087 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik2P39087 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms