Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprkP35822 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprkP35822 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprkP35822 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprkP35822 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprkP35822 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms