Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly6dP35459 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6dP35459 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms