Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk4P30285 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms