Protein–RNA interactions for Protein: P30275

Ckmt1, Creatine kinase U-type, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckmt1P30275 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ckmt1P30275 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms