Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VtnP29788 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VtnP29788 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VtnP29788 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VtnP29788 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VtnP29788 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VtnP29788 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VtnP29788 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VtnP29788 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VtnP29788 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VtnP29788 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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