Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprmP28828 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprmP28828 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprmP28828 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprmP28828 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprmP28828 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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