Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfraP26618 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfraP26618 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms