Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NefhP19246 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NefhP19246 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NefhP19246 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NefhP19246 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NefhP19246 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NefhP19246 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NefhP19246 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NefhP19246 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NefhP19246 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NefhP19246 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NefhP19246 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NefhP19246 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NefhP19246 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NefhP19246 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NefhP19246 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NefhP19246 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NefhP19246 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NefhP19246 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NefhP19246 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NefhP19246 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NefhP19246 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NefhP19246 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NefhP19246 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NefhP19246 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NefhP19246 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms