Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcnaP17918 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcnaP17918 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcnaP17918 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PcnaP17918 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcnaP17918 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcnaP17918 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcnaP17918 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcnaP17918 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcnaP17918 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcnaP17918 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PcnaP17918 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PcnaP17918 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcnaP17918 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcnaP17918 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PcnaP17918 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PcnaP17918 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PcnaP17918 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcnaP17918 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PcnaP17918 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcnaP17918 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcnaP17918 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcnaP17918 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcnaP17918 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PcnaP17918 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PcnaP17918 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PcnaP17918 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcnaP17918 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms