Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhoP15409 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhoP15409 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhoP15409 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms