Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp54P14576 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms