Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrm1P12657 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms